网上办理流程：
1.申请 申请人登录广东省政务服务网提出申请，上传电子材料。市水务局工作人员预审后，若存在不符合申请资格或不齐全、不符合法定形式的材料，将通过系统一次性告补正材料或告知不予办理的原因；若材料符合，申请人将申请材料打印签字盖章交至或快递到窗口。
2.受理
接收受理人员对材料进行审查，在1个工作日内提出受理意见。若申请材料齐全、格式规范并符合法定形式，则予以受理，出具《受理回执》；申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件受理人员不予受理，出具《不予受理通知书》。
3、审核（4个工作日）:
（1）技术审查（20个工作日）
1）委托。委托技术审查单位进行技术审查工作。
2）技术审查。技术审查单位在规定时间内按照规范要求对技术报告进行技术审查，并出具技术审查意见；如技术报告需要修改、完善的，应向申请人出具技术审查初步审查意见，并要求申请人在规定时间内提交经修改的技术报告。
（2）审核（4个工作日）
实施机关自收到技术审查意见之日起4个工作日内，根据申请材料及技术审查意见进行审批审查。
4.审批（3个工作日）经初步审查符合要求后，提出拟办意见报副处长审核后，报处长决定办结。
5.决定（3个工作日） 决定人员在所有审查环节完成后3个工作日内作出审查决定。
6.办结：符合通过条件的，出具《深圳市水务局行政服务告知书》；不予通过的，不予以注册登记核准。
7.送达 申请人按约定的方式网上打印、窗口自取或以邮寄的方式领取办理结果。

窗口办理流程：
1.申请 申请人登录广东省政务服务网提出申请，上传电子材料。市水务局工作人员预审后，若存在不符合申请资格或不齐全、不符合法定形式的材料，将通过系统一次性告补正材料或告知不予办理的原因；若材料符合，申请人将申请材料打印签字盖章交至或快递到窗口。
2.受理
接收受理人员对材料进行审查，在1个工作日内提出受理意见。若申请材料齐全、格式规范并符合法定形式，则予以受理，出具《受理回执》；申请人不符合申请资格或材料不齐全、不符合法定形式的，接件受理人员不予受理，出具《不予受理通知书》。
3、审核（4个工作日）:
（1）技术审查（20个工作日）
1）委托。委托技术审查单位进行技术审查工作。
2）技术审查。技术审查单位在规定时间内按照规范要求对技术报告进行技术审查，并出具技术审查意见；如技术报告需要修改、完善的，应向申请人出具技术审查初步审查意见，并要求申请人在规定时间内提交经修改的技术报告。
（2）审核（4个工作日）
实施机关自收到技术审查意见之日起4个工作日内，根据申请材料及技术审查意见进行审批审查。
4.审批（3个工作日）经初步审查符合要求后，提出拟办意见报副处长审核后，报处长决定办结。
5.决定（3个工作日） 决定人员在所有审查环节完成后3个工作日内作出审查决定。
6.办结：符合通过条件的，出具《深圳市水务局行政服务告知书》；不予通过的，不予以注册登记核准。
7.送达 申请人按约定的方式网上打印、窗口自取或以邮寄的方式领取办理结果。